很多人都知道喝酸奶对身体有好处，然而未必人人都懂得如何科学地喝。
保健专家认为，饭后两小时内饮用酸奶为最佳时机。人的胃液酸碱度的PH值通常在1-3之间，空腹时的PH值在2以下，而酸奶中活性乳酸菌生长的酸碱度PH值在5.4以上，如果在空腹时喝酸奶，乳酸菌很容易被胃酸杀死，其营养和保健作用就会大大减弱。如果在饭后喝酸奶，这时胃液被稀释，PH值会上升到3-5，这种环境很适合乳酸菌的生长。
酸奶不能加热喝。酸奶一经蒸煮加热后，所含的大量活性乳酸菌会被杀死，营养和保健功能便不存在，其物理性状也会发生，产生分离沉淀，酸奶特有的口味和口感都会消失。夏季饮用宜现买现喝，冬季可在室温条件下放置一定后再饮用。
饮用酸奶后要用白开水漱口。对于儿童来说，喝完酸奶后如不进行漱口，酸奶中的某些菌种及所含的一定酸度，特别容易导致龋齿现象。
不能用酸奶服药。特别是用酸奶服用氯霉素、红霉素等抗生素及磺胺类药物以及服用治疗腹泻的一些药物，因为这些药物同样会破坏或杀死酸奶中的乳酸菌。