吸烟会使精子的数量减少和活动率降低，畸形精子的发生率增多。吸烟者吸入尼古丁作用于生产精子的曲细精管的生精上皮，使其生精功能减退，因而生产出来的精子数目减少，质量降低。澳大利亚的临床医生研究发现：吸烟者的平均每毫升精液中的精子数0.27亿个，活动率为49.27%；每天吸20支烟以上者有6%的人每毫升精液的精子仅为0.01亿个，明显低于受精所需的基本数目，因而不育。此外，吸烟者发生精索静脉曲张率是不吸烟者的10倍，而这又是使精子减少，活性降低，导致不育的原因之一。
吸烟对男性致命的危害，是使男子发生阳萎。研究证实，长期吸烟者，会引起包括阴茎血管在内的人体末端小血管发生栓塞，阴茎血液供应不良而出现阳萎。阳萎造成夫妻无法过正常的性生活，不仅发生不育，还会影响夫妻、生活和和睦。1986年，比勒陀利亚对116名阳萎患者调查，发现108人是烟鬼。另一项调查发现，吸烟者患阳萎比不吸烟者高2倍，但戒烟后部分阳萎患者可自愈。